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circRNA研究匯總 | 20200406-0412
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2020-04-13 | 297 次瀏覽 | 分享到:

歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻共計29篇,下面我們一起來看看,circRNA研究最近有哪些新進展。

檢索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 



1、E2F1和EIF4A3介導的circRNA circSEPT9促進三陰性乳腺癌的發生和發展。

標題:The circRNA circSEPT9 mediated by E2F1 and EIF4A3 facilitates the carcinogenesis and development of triple-negative breast cancer.

雜志:Mol Cancer

影響因子:10.679

通訊作者:陳俊霞教授(重慶醫科大學)


越來越多的研究表明,circRNA與許多癌癥的癌變和發展密切相關。然而,到目前為止,尚不清楚三陰性乳腺癌(TNBC)中circRNA的生物學功能和潛在的分子機制。該研究中,作者使用RNA高通量測序研究了circRNA在四對TNBC組織和癌旁正常組織中的表達模式。通過qRT-PCR和原位雜交在兩個TNBC隊列中評估了circSEPT9的表達和預后意義。通過Kaplan-Meier方法繪制生存曲線,并進行了一系列的體外和體內功能實驗,以研究circSEPT9在TNBC癌變和發展中的作用。從機制上講,染色質免疫沉淀(ChIP),螢光素酶報告基因和RNA免疫沉淀(RIP)分析方法探討了E2F1和EIF4A3對circSEPT9生物發生的潛在調控作用。此外,熒光原位雜交(FISH),熒光素酶報告基因和生物素偶聯的RNA-pulldwon技術,驗證TNBC中circSEPT9和miR-637之間的關系。結果表明:circSEPT9在TNBC組織中的表達增加,這與TNBC晚期臨床和預后不良呈正相關。敲低circSEPT9可以顯著抑制TNBC細胞的增殖,遷移和侵襲,誘導TNBC細胞凋亡和自噬,并抑制體內腫瘤的生長和轉移。而上調circSEPT9則發揮相反的作用。進一步的機制研究表明,circSEPT9可以通過使miR-637海綿化來調節白血病抑制因子(LIF)的表達,并激活涉及TNBC的LIF / Stat3信號通路。該研究結論表明,E2F1和EIF4A3介導的circSEPT9通過circSEPT9 / miR-637 / LIF軸促進了三陰性乳腺癌的發生和發展。因此,circSEPT9可用作TNBC的潛在預后標志物和治療靶標。


圖注:circSEPT9促進三陰性乳腺癌的發生和發展的作用機制示意圖。



2、
(綜述)在過去的幾十年中出現的用于肝細胞癌的機制,診斷和治療的新型核酸分子。

標題:The mechanistic, diagnostic and therapeutic novel nucleic acids for hepatocellular carcinoma emerging in past score years.

雜志:Brief Bioinform

影響因子:9.101

通訊作者:裘云慶教授(浙江大學第一附屬醫院)Feng Zhu(浙江大學藥學院)。


盡管中心法則指出基因的命運是“ DNA轉錄RNA和RNA翻譯蛋白質”,但核酸不僅存儲和傳遞遺傳信息,而且可調控細胞內重要活動,成為基因表達的調節劑。生物信息學為一系列新興的新型核酸分子的研究做出了貢獻。典型的如:microRNA(miRNA),長非編碼RNA(lncRNA)和環狀RNA(circRNA)在調節重要的生物學過程(尤其是惡性疾?。┲衅鹬陵P重要的作用。由于惡性腫瘤的異質性,肝細胞癌(HCC)在診斷和治療方面已存在巨大的局限性。該綜述文章對過去的幾十年中出現的用于HCC的機制,診斷和核酸治療進行了系統的整理。特別是,作者將HCC相關的核酸分子的最新進展分為三個方面進行闡述:(i)概述了各種核酸分子及其修飾(miRNA,lncRNA,circRNA,ctDNA和ctDNA甲基化),它們在HCC診斷中起著潛在的生物標志物作用;(ii)三種主要非編碼RNA(miRNA,lncRNA和circRNA)在基因調控中的不同模式,以及(iii)概述用于肝癌診斷和治療的新型核酸在臨床試驗中的進展,并討論其在臨床應用中的可能性??偠灾?,該綜述詳細探討了HCC新型核酸分子的發展,從潛在的生物標志物到具體分子機制以及過去20年的早期臨床應用進行了詳盡闡述。


圖注:HCC肝癌相關的circRNA分子統計表



3、
環狀RNA hsa_circ_0000326可作為miR-338-3p海綿來促進肺腺癌的進展。

標題:Circular RNA hsa_circ_0000326 acts as a miR-338-3p sponge to facilitate lung adenocarcinoma progression.

雜志:J Exp Clin Cancer Res

影響因子:5.646 ;

通訊作者:趙建平和熊維寧教授(華中科技大學附屬同濟醫院)


該研究主要聚焦circRNA在肺腺癌中的作用機制研究。研究者首先使用微陣列芯片和qRT-PCR在人肺腺癌組織中鑒定了一種新型上調的circRNA分子——hsa_circ_0000326。然后,研究者通過功能獲得和功能缺失研究測定肺腺癌細胞中的hsa_circ_0000326的生物學作用。生物信息學數據庫用于篩選circRNA潛在的靶標miRNA,螢光素酶報告基因和RNA-FISH進一步驗證了兩者相互作用。通過WB實驗檢測下游蛋白質。最后,建立裸鼠異種移植,以評估hsa_circ_0000326體內的功能。研究結果表明,hsa_circ_0000326的高表達與人類肺腺癌的腫瘤大小,區域淋巴結狀態和分化程度相關。此外,體外細胞功能實驗,發現hsa_circ_0000326充當細胞增殖和遷移的正調節劑和凋亡的負調節劑。機理研究表明,hsa_circ_0000326充當miR-338-3p海綿并改變了miR-338-3p的功能,進而上調了其下游靶標RAB14的表達并影響了肺腺癌細胞的增殖,遷移和凋亡??傮w而言,該研究結果揭示了hsa_circ_0000326在肺腺癌細胞的增殖,遷移和凋亡中的關鍵作用,并暗示hsa_circ_0000326可能代表了肺腺癌患者的潛在治療靶標。


圖注:hsa_circ_0000326在肺腺癌中的作用功能示意圖
參考文獻列表

序號

主要內容

論文標題

雜志

IF

單位

1

E2F1和EIF4A3介導的circRNA circSEPT9促進三陰性乳腺癌的發生和發展。

The circRNA circSEPT9 mediated by E2F1 and EIF4A3 facilitates the carcinogenesis and development of triple-negative breast cancer.

Mol Cancer

10.679

重慶醫科大學

2

在過去的幾十年中出現的用于肝細胞癌的機制,診斷和治療的新型核酸分子。

The mechanistic, diagnostic and therapeutic novel nucleic acids for hepatocellular carcinoma emerging in past score years.

Brief Bioinform

9.101

浙江大學藥學院等

3

環狀RNA hsa_circ_0000326可作為miR-338-3p海綿來促進肺腺癌的進展。

Circular RNA hsa_circ_0000326 acts as a miR-338-3p sponge to facilitate lung adenocarcinoma progression.

J Exp Clin Cancer Res

5.646

華中科技大學附屬同濟醫院等

4

環狀RNA測序表明circ-IQGAP2和circ-ZC3H6是原發性干燥綜合征的無創性生物標志物。

Circular RNA sequencing indicates circ-IQGAP2 and circ-ZC3H6 as noninvasive biomarkers of primary Sj?gren's syndrome.

Rheumatology (Oxford)

5.149

溫州醫科大學等

5

非編碼RNA:瓣膜鈣化的調節劑。

Non-coding RNAs: Regulators of valvular calcification.

J Mol Cell Cardiol

5.055

印度中央藥物研究所等

6

環狀RNA PVT1通過調節OS細胞中的miR-526b / FOXC2信號促進細胞轉移。

Circular RNA PVT1 promotes metastasis via regulating of miR-526b/FOXC2 signals in OS cells.

J Cell Mol Med

4.658

吉林大學第一醫院等

7

CircMiner:通過剪接感知偽比對方案準確快速檢測環狀RNA。

CircMiner: Accurate and Rapid Detection of Circular RNA through Splice-Aware Pseudo-Alignment Scheme.

Bioinformatics

4.531

加拿大不列顛哥倫比亞大學等

8

非編碼RNA在自身免疫性甲狀腺疾病中的新興作用。

Emerging roles for non-coding RNAs in Autoimmune thyroid disease.

Endocrinology

3.8

南方醫科大學順德醫院等

9

Hsa_circ_0031288 / hsa-miR-139-3p / Bcl-6調節反饋回路影響宮頸癌HeLa細胞的侵襲和遷移。

Hsa_circ_0031288/hsa-miR-139-3p/Bcl-6 regulatory feedback circuit influences the invasion and migration of cervical cancer HeLa cells.

J Cell Biochem

3.448

河南周口市中心醫院等

10

小檗堿通過調節人神經元細胞中的circHDAC9 / miR-142-5p軸來減輕Aβ42誘導的神經元損傷。

Berberine attenuates Aβ42-induced neuronal damage through regulating circHDAC9/miR-142-5p axis in human neuronal cells.

Life Sci

3.448

濱州醫學院煙臺附屬醫院等

11

抑制環狀RNA circVAPA可通過調節miR-125a / CREB5軸抑制大腸癌細胞的生長過程。

Circular RNA circVAPA knockdown suppresses colorectal cancer cell growth process by regulating miR-125a/CREB5 axis.

Cancer Cell Int

3.439

吉林大學中日聯合醫院等

12

下調hsa_circ_0077837和hsa_circ_0004826有助于膀胱癌的進展并預測膀胱癌患者的不良預后。

Downregulated hsa_circ_0077837 and hsa_circ_0004826, facilitate bladder cancer progression and predict poor prognosis for bladder cancer patients.

Cancer Med

3.357

天津醫科大學第二醫院等

13

環狀RNA及其參與癌癥干性調控。

Circular RNAs and their participation in stemness of cancer.

Med Oncol

3.252

墨西哥CINVESTAV分子遺傳部等

14

抑制CircRNA ZNF609通過調節miR-188 / ELF2軸抑制鼻咽癌的細胞生長。

CircRNA ZNF609 Knockdown Suppresses Cell Growth via Modulating miR-188/ELF2 Axis in Nasopharyngeal Carcinoma.

Onco Targets Ther

3.046

鄭州市中心醫院等

15

新型circRNA-0060745通過miR-4736海綿促進大腸癌細胞的增殖和轉移。

Circular RNA 0060745, a Novel circRNA, Promotes Colorectal Cancer Cell Proliferation and Metastasis Through miR-4736 Sponging.

Onco Targets Ther

3.046

中國醫科大學腫瘤醫院等

16

Circ_CHFR通過miR-214-3p / Wnt3 /β-catenin途徑加速經ox-LDL處理的人血管平滑肌細胞的細胞生長,遷移和炎癥。

Circ_CHFR expedites cell growth, migration and inflammation in ox-LDL-treated human vascular smooth muscle cells via the miR-214-3p/Wnt3/β-catenin pathway.

Eur Rev Med Pharmacol Sci

2.721

天津市第三中心醫院等

17

hsa_circ_0006156表達與胃癌發生率之間的關聯。

Association between hsa_circ_0006156 expression and incidence of gastric cancer.

Eur Rev Med Pharmacol Sci

2.721

山東大學附屬山東省醫院等

18

CircRNA SCARB1通過miR-510-5p / SDC3軸促進腎細胞癌的進展。

CircRNA SCARB1 promotes renal cell carcinoma progression via miR-510-5p/SDC3 axis.

Curr Cancer Drug Targets

2.72

鄭州市中醫院等

19

CircRNACCDC66通過miR-618 / BCL2軸調節胃癌的順鉑耐藥性。

CircRNACCDC66 regulates cisplatin resistance in gastric cancer via the miR-618/BCL2 axis.

Biochem Biophys Res Commun

2.705

連云港市第二人民醫院等

20

線性HIPK3衍生的circRNA通過ceRNA模式減輕脊髓損傷中神經元細胞的凋亡。

A circRNA derived from linear HIPK3 relieves the neuronal cell apoptosis in spinal cord injury via ceRNA pattern.

Biochem Biophys Res Commun

2.705

同濟大學醫學院等

21

circRNA_0084043通過使miR-140-3p海綿化并誘導視網膜色素上皮細胞中TGFA基因表達來促進糖尿病性視網膜病變的發展。

circRNA_0084043 contributes to the progression of diabetic retinopathy via sponging miR-140-3p and inducing TGFA gene expression in retinal pigment epithelial cells.

Gene

2.638

武漢大學人民醫院等

22

環狀RNA hsa_circ_0002052通過調節miR-382 / STX6軸促進骨肉瘤。

Circular RNA hsa_circ_0002052 promotes osteosarcoma via modulating miR-382/STX6 axis.

Hum Cell

2.333

曲靖市第一人民醫院等

23

豬卵泡閉鎖啟動過程中環狀RNA的潛在生物學功能。

The potential biological functions of circular RNAs during the initiation of atresia in pig follicles.

Domest Anim Endocrinol

2.302

南京農業大學等

24

Circ-ABCB10通過Let-7a-5p / DUSP7軸促進乳腺癌的紫杉醇耐藥性。

Circ-ABCB10 Contributes to Paclitaxel Resistance in Breast Cancer Through Let-7a-5p/DUSP7 Axis.

Cancer Manag Res

2.243

青島市城陽區人民醫院等

25

hsa_circRNA_101237:多發性骨髓瘤的新型診斷和預后生物標志物及潛在治療靶標。

hsa_circRNA_101237: A Novel Diagnostic and Prognostic Biomarker and Potential Therapeutic Target for Multiple Myeloma.

Cancer Manag Res

2.243

中南大學湘雅第三醫院等

26

環狀RNA has_circ_0000527通過miR-646 / BCL-2軸參與成視網膜細胞瘤細胞的增殖,侵襲和遷移。

Circular RNA has_circ_0000527 participates in proliferation, invasion and migration of retinoblastoma cells via miR-646/BCL-2 axis.

Cell Biochem Funct

2.142

山東陽光融和醫院等

27

circRNA失調在非小細胞肺癌患者中的預后作用:一項薈萃分析。

Prognostic role of dysregulated circRNAs in patients with non-small cell lung cancer: a meta-analysis.

J Thorac Dis

2.027

復旦大學等

28

外泌體環狀RNA分選機制及其在促進或抑制癌癥中的作用。

Exosomal circular RNA sorting mechanisms and their function in promoting or inhibiting cancer.

Oncol Lett

1.871

河北中醫藥大學等

29

CircRNA_101951通過調節KIF3A介導的EMT途徑來促進結直腸癌細胞的遷移和侵襲。

CircRNA_101951 promotes migration and invasion of colorectal cancer cells by regulating the KIF3A-mediated EMT pathway.

Exp Ther Med

1.448

臨沂市中心醫院等



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